日元利率是指以日本货币单位日元计算的利率。其计算方法和其他货币的利率计算方法基本相同，主要包括以下几个方面：

1. 基准利率：日本央行（日本银行）通过货币政策决定基准利率。基准利率是指日本央行向其他金融机构提供短期资金的利率水平。这个利率会影响到整个金融市场的利率水平。

2. 借贷利率：金融机构向客户提供贷款或信贷时，会根据借款期限、借款金额、借款对象的信用评级等因素确定利率。通常，借款期限越长、借款金额越大、借款对象的信用评级越低，利率会相应提高。

3. 存款利率：金融机构向客户吸收存款时，会根据存款期限和存款金额确定存款利率。一般来说，存款期限越长、存款金额越大，存款利率会相应提高。

4. 通货膨胀率：通货膨胀率也会对日元利率产生一定影响。通常情况下，当通货膨胀率上升时，央行可能会采取加息措施，以抑制通胀。这会导致利率上升。

需要注意的是，日元利率的具体计算方式可能会因金融机构和具体产品的不同而有所差异。此外，日本央行的货币政策决策和市场情况也会对日元利率产生影响。因此，日元利率的变动需要综合考虑多种因素。